В случае обустройства дымоходов на крыше без рельефа (не всегда) вместо гибких проходных изделий применяют проходной патрубок из металла. Это тоже готовые изделия, окрашенные или из оцинкованной стали:
Изготавливают такие патрубки в основном из легированной стали стандартных размеров и под стандартные углы наклона кровли.
Здесь инструкция уже немного другая: